停经40天B超未发现孕囊可能由妊娠时间过短、异位妊娠、生化妊娠、胚胎发育异常或月经周期不规律等原因引起，需结合血HCG检测及其他检查进一步明确。

1、妊娠时间过短：

正常妊娠情况下，孕囊通常在停经5周左右通过阴道B超可见，腹部B超可能需延迟1周。若排卵推迟或受精时间较晚，实际孕周小于停经周数，B超检查时孕囊尚未形成。建议间隔1-2周复查B超，同时监测血HCG翻倍情况。

2、异位妊娠：

受精卵在子宫腔外着床称为异位妊娠，最常见为输卵管妊娠。此时血HCG水平上升但宫腔内无孕囊，可能伴随单侧下腹隐痛、阴道点滴出血。需通过连续血HCG监测及阴道超声排查，确诊后需药物或手术治疗。

3、生化妊娠：

指受精卵未成功着床即发生流产，血HCG呈一过性升高后下降，超声检查始终无孕囊结构。多与胚胎染色体异常有关，表现为月经延迟后阴道出血量稍多，通常无需特殊处理但需排除其他病理因素。

4、胚胎发育异常：

包括胚胎停育或空孕囊等情况，可能与染色体异常、黄体功能不足等因素有关。血HCG上升缓慢或不升，超声显示妊娠囊形态不规则、无卵黄囊结构。需通过系列检查确认后行清宫术终止妊娠。

5、月经周期不规律：

长期月经紊乱者可能错误估算停经时间，实际排卵期推迟导致孕周计算偏差。需结合末次月经、排卵试纸记录或基础体温曲线重新评估，必要时通过孕早期超声测量头臀长校正孕周。

建议暂停剧烈运动并避免性生活，每日记录基础体温变化，保持外阴清洁预防感染。饮食注意补充优质蛋白质如鱼肉、豆制品，增加深色蔬菜摄入。若出现剧烈腹痛、大量出血或晕厥需立即就医。心理上需避免过度焦虑，可通过正念冥想缓解压力，等待复查期间建议有家属陪同。