肠镜检查通常不会对身体造成明显伤害，但可能存在轻微不适或罕见并发症。肠镜的主要风险包括肠道穿孔、出血、麻醉相关反应，以及检查后短暂腹胀。多数情况下这些风险发生概率较低，且与患者肠道状况、操作规范程度密切相关。

肠镜检查作为侵入性操作，需将内镜经肛门插入肠道，可能对黏膜产生机械性摩擦。健康人群的肠道黏膜修复能力强，轻微擦伤可在短时间内自行愈合。操作过程中充气扩张肠道可能引发腹胀腹痛，通常排气后可缓解。部分患者因肠道弯曲或粘连，进镜难度增加，可能需调整体位或施加压力，但专业医师会通过手法减轻不适。

少数患者存在肠道结构异常、炎症活动期或凝血功能障碍时，穿孔或出血风险相对升高。肠道肿瘤患者若病变侵蚀肠壁，活检可能导致出血量增多。麻醉药物可能引发过敏反应或呼吸抑制，但术前评估可有效规避风险。高龄、心肺功能不全者需加强术中监护，必要时选择无痛肠镜以外的检查方案。

建议检查前严格遵医嘱进行肠道准备，避免残留粪便影响观察。术后两小时内禁食，逐步从流质过渡到正常饮食。出现持续腹痛、便血或发热需立即就医。定期肠镜筛查能早期发现肠道病变，利大于弊，高危人群应按照医生建议的频率接受检查。