月经干净后三天同房存在怀孕可能，但概率相对较低。怀孕风险主要与排卵时间、月经周期规律性、精子存活时间、卵子存活时间以及个体差异等因素有关。

1、排卵时间：

女性排卵通常发生在下次月经前14天左右。若月经周期为28天且规律，月经干净后三天距离排卵日较远，怀孕概率较低。但周期缩短至21天时，此时同房可能接近排卵期。

2、周期规律性：

月经周期不规律会显著影响排卵时间判断。多囊卵巢综合征、压力或药物等因素导致周期紊乱时，可能出现意外排卵，此时安全期计算失效。

3、精子存活时间：

精子在女性生殖道内可存活2-3天，少数可达5天。若同房后3天内发生排卵，残留精子仍可能使卵子受精。

4、卵子存活时间：

排卵后卵子仅能存活12-24小时。但排卵时间难以精确预测，尤其周期不规律者可能发生突发性排卵。

5、个体差异：

基础体温升高、宫颈黏液变化等排卵征兆存在个体差异。部分女性会出现经期排卵或周期内多次排卵现象。

建议同房后21天使用早孕试纸检测，或观察下次月经来潮情况。日常可记录基础体温、宫颈黏液变化辅助判断排卵期，周期紊乱者建议采用避孕套等可靠避孕方式。保持规律作息有助于稳定月经周期，避免过度节食或剧烈运动影响内分泌。若需长期避孕，可咨询医生选择适合的避孕措施。