肠镜检查后可能出现肛门轻微疼痛，但通常属于短暂不适。肠镜操作过程中对肛门及直肠的机械刺激是引起不适的主要原因，多数情况下疼痛感会在数小时内自行缓解。

肠镜检查需将内窥镜经肛门插入肠道，器械摩擦可能造成肛门括约肌短暂痉挛或黏膜轻微擦伤，表现为检查后肛门隐痛或灼热感。这种疼痛通常程度较轻，持续时间不超过24小时，可通过温水坐浴或局部热敷缓解。检查前医生会使用润滑剂减少摩擦，操作手法轻柔的患者疼痛概率更低。部分敏感人群可能对肠镜充气过程产生胀痛感，但排气后症状会快速消失。

少数情况下若出现持续肛门剧痛、出血或发热，可能与检查后并发症相关。肠镜活检取材可能造成直肠黏膜深层损伤，引发局部炎症反应。过度充气可能导致肠壁张力过高，诱发痉挛性疼痛。既往有肛裂、痔疮急性发作的患者，肠镜刺激可能加重原有病变。这类情况需及时就医排除穿孔、感染等风险，必要时使用盐酸利多卡因胶浆局部镇痛或口服布洛芬缓释胶囊抗炎。

检查后2天内应避免辛辣饮食及剧烈运动，保持肛周清洁干燥。选择宽松棉质内衣减少摩擦，排便时勿过度用力。若疼痛伴随排便困难或肛门坠胀感持续3天未缓解，需到消化内科复查电子肠镜排除黏膜损伤。日常可增加膳食纤维摄入预防便秘，定期进行提肛运动增强括约肌功能。