肾囊肿是否影响肾功能取决于囊肿类型、大小及是否引发并发症。单纯性肾囊肿通常不影响肾功能，而多囊肾等遗传性疾病可能导致肾功能逐渐下降。

单纯性肾囊肿是肾脏常见的良性病变，多为单发且体积较小，生长缓慢。这类囊肿通常不会压迫正常肾组织，也不会干扰肾脏的滤过和排泄功能。多数患者无自觉症状，仅在体检时通过超声检查发现。若囊肿直径超过5厘米或位置特殊压迫输尿管，可能引起腰部胀痛或尿路梗阻，此时需通过超声引导下穿刺抽液或腹腔镜手术解除压迫。

多囊肾属于常染色体遗传病，表现为双肾弥漫性多发囊肿。随着囊肿数量增多、体积增大，正常肾单位会逐渐被挤压破坏，导致肾小球滤过率进行性下降。患者可能出现高血压、血尿、蛋白尿等症状，最终可能发展为终末期肾病。早期可通过控制血压、限制蛋白摄入延缓进展，晚期需接受透析或肾移植治疗。其他复杂囊肿如感染性囊肿或囊壁钙化囊肿，可能合并肾盂肾炎或肾功能急性损伤，需抗感染治疗或手术干预。

建议肾囊肿患者每6-12个月复查肾脏超声监测变化，避免剧烈运动防止囊肿破裂。日常需保持低盐饮食，控制每日饮水量在1500-2000毫升，合并高血压者应定期监测血压。若出现持续腰痛、血尿或尿量明显减少，应及时就诊评估肾功能。