月经干净三天同房存在怀孕可能，但概率相对较低。怀孕风险主要与排卵时间、精子存活期、月经周期规律性等因素相关。

1、排卵时间：

女性排卵通常发生在下次月经前14天左右。若月经周期为28天，月经干净后3天处于安全期，但周期缩短至21天时，此时同房可能临近排卵期。排卵受情绪、压力等因素影响可能提前，安全期计算并非绝对可靠。

2、精子存活期：

精子在女性生殖道内可存活2-3天。若月经结束后3天同房，之后2天内发生排卵，存活的精子仍可能使卵子受精。部分研究显示个别情况下精子存活时间可达5天。

3、周期规律性：

月经周期不规律会显著影响安全期判断。周期波动超过7天的女性，排卵日可能提前或延后1周以上。多囊卵巢综合征等疾病会导致周期紊乱，进一步增加意外排卵风险。

4、子宫内膜状态：

月经刚结束时子宫内膜较薄，理论上不利于受精卵着床。但若发生排卵且受精成功，孕激素会促使内膜增厚，部分女性仍可能完成着床过程。

5、激素水平变化：

月经结束后卵泡开始发育，雌激素水平逐渐上升。某些女性在月经周期第7-8天即出现促黄体生成素高峰，可能导致排卵提前，这种情况在青春期和围绝经期更常见。

建议同房时采取避孕套等防护措施，尤其对于周期不规律者。可记录基础体温或使用排卵试纸监测排卵情况。若月经延迟超过7天需进行早孕检测，日常保持适度运动如瑜伽、快走等有助于调节内分泌，饮食注意补充富含维生素B族的全谷物和绿叶蔬菜，避免过度节食或暴饮暴食影响激素平衡。