怀孕46天B超看不到孕囊可能与胚胎发育较慢、排卵时间延迟、宫外孕、胚胎停育等因素有关，需结合血HCG和孕酮水平进一步评估。

1、胚胎发育较慢：部分孕妇的胚胎发育速度较慢，可能导致孕囊在46天时尚未显现。建议定期复查B超，观察胚胎发育情况，同时注意休息，避免过度劳累，保持良好的心态。

2、排卵时间延迟：如果排卵时间比预期晚，受精卵着床时间也会相应推迟，导致B超看不到孕囊。可以通过监测基础体温或使用排卵试纸确认排卵时间，必要时调整孕周计算。

3、宫外孕：宫外孕是指受精卵在子宫外着床，常见于输卵管。B超看不到孕囊时，需警惕宫外孕的可能性。宫外孕可能伴随腹痛、阴道出血等症状，需及时就医，通过血HCG和B超进一步确诊。

4、胚胎停育：胚胎停育是指胚胎在发育过程中停止生长，可能导致B超看不到孕囊。胚胎停育可能伴随早孕反应消失、阴道出血等症状，需通过血HCG和B超确诊，必要时进行清宫手术。

5、其他因素：如B超设备分辨率低、检查技术不准确等，也可能导致B超看不到孕囊。建议选择正规医疗机构进行复查，确保检查结果的准确性。

孕妇在怀孕初期应保持均衡饮食，多摄入富含蛋白质、维生素和矿物质的食物，如鸡蛋、牛奶、绿叶蔬菜等。适量运动有助于促进血液循环，增强体质，但应避免剧烈运动。定期产检，密切关注胚胎发育情况，如有异常及时就医。保持良好的心态，避免过度焦虑，有助于胚胎健康发育。