怀孕40天通常可以遵医嘱进行药物流产。药物流产适用于妊娠49天内的早期妊娠终止，主要使用米非司酮片配合米索前列醇片。药物流产的成功概率与孕囊大小、着床位置及个体对药物的敏感性有关。进行药物流产前必须通过B超确认宫内妊娠，并排除药物禁忌症如严重贫血、肾上腺疾病等。药物流产可能导致不完全流产、大出血等风险，须在正规医疗机构监护下进行。

药物流产通过阻断孕酮受体和诱发宫缩实现妊娠终止。米非司酮片可软化宫颈并剥离胚胎，米索前列醇片促进子宫收缩排出妊娠组织。用药后需观察阴道出血量及组织物排出情况，出血时间一般持续10-14天。用药后第8-15天必须复查B超确认流产效果，若存在宫腔残留需根据情况选择清宫手术或药物治疗。药物流产期间可能出现剧烈腹痛、发热等不良反应，需及时就医处理。

存在瘢痕子宫、异位妊娠史或哺乳期妇女需谨慎选择药物流产。多次流产史患者可能面临宫腔粘连风险，40岁以上女性药物流产失败概率可能增加。患有哮喘、青光眼或心血管疾病者需评估药物安全性。药物流产后需禁止性生活及盆浴1个月，注意会阴清洁预防感染。流产后建议完善避孕指导，短期内重复流产可能损害子宫内膜。

药物流产后应适当休息但避免绝对卧床，适度活动有助于宫腔积血排出。饮食需保证优质蛋白和铁元素摄入，可适量进食瘦肉、动物肝脏等补血食物。两周内避免剧烈运动和重体力劳动，观察月经恢复情况。如出现持续腹痛、异常分泌物或月经延迟需及时复诊。心理疏导对流产后情绪调节很重要，可寻求专业心理咨询帮助处理焦虑抑郁情绪。