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生殖器疱疹潜伏期一般为2-12天，实际时间受到病毒载量、免疫状态、感染部位、首次感染或复发等多种因素影响。
1、病毒载量接触病毒数量较多时潜伏期可能缩短，病毒通过皮肤黏膜破损处侵入神经节形成潜伏感染。
2、免疫状态免疫功能低下者潜伏期可能缩短，HIV感染者或长期使用免疫抑制剂人群可能出现更早发病。
3、感染部位会阴部皮肤较薄区域感染后出现症状较快，宫颈等深部组织感染可能延迟出现临床表现。
4、感染类型初次感染潜伏期通常较长，复发感染因体内已存在抗体，潜伏期相对缩短且症状较轻。
潜伏期内虽无可见皮损但仍具传染性，建议避免高危性行为并保持患处清洁干燥，出现簇集性水疱需及时皮肤科就诊。
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