怀孕三个月腰疼厉害可能由激素水平变化、子宫增大压迫、缺钙、姿势不当、泌尿系统感染等原因引起，可通过调整姿势、补钙、物理治疗、控制感染、适当运动等方式缓解。

1、激素水平变化：

妊娠期孕激素和松弛素水平升高会导致韧带松弛，腰椎稳定性下降，可能引起腰部酸痛。这种情况属于生理性改变，建议避免久站久坐，睡眠时用孕妇枕支撑腰部。

2、子宫增大压迫：

随着子宫体积增大，可能压迫腰骶神经丛，表现为持续性钝痛。这种疼痛在仰卧位时可能加重，建议采取左侧卧位休息，日常可使用托腹带分担压力。

3、缺钙：

胎儿骨骼发育需要大量钙质，母体钙储备不足可能引起骨质疏松样疼痛。孕中期每日钙需求量为1000-1200毫克，可通过牛奶、豆制品等食物补充，必要时在医生指导下服用钙剂。

4、姿势不当：

孕妇重心前移易导致腰椎前凸过度，长期保持错误姿势会加重腰部肌肉劳损。应避免穿高跟鞋，坐立时保持背部挺直，必要时进行孕妇瑜伽改善体态。

5、泌尿系统感染：

妊娠期泌尿系统感染发生率较高，可能表现为腰痛伴尿频尿急。需进行尿常规检查确认，确诊后需在医生指导下使用对胎儿安全的抗生素治疗。

孕期腰痛需注意保持适度活动，如散步、游泳等低冲击运动可增强腰背肌力量；饮食上增加富含钙镁的食物如芝麻、深绿色蔬菜；避免提重物或突然转身等动作。若疼痛持续加重或出现阴道流血、发热等症状，需立即就医排除先兆流产、肾盂肾炎等病理情况。建议睡眠时采取双腿间夹枕的侧卧位，日常可进行骨盆倾斜运动缓解压力。