HPV四价疫苗和九价疫苗的主要区别在于预防的病毒亚型数量及覆盖范围，九价可预防更多高危型HPV感染。两种疫苗均能预防HPV16和18型引起的宫颈癌，但九价额外覆盖31、33、45、52、58五种高危型及6、11两种低危型，防护范围更广。

四价疫苗针对HPV6、11、16、18四种亚型，其中16和18型导致约70％宫颈癌，6和11型引发生殖器疣。九价疫苗在此基础上新增31、33、45、52、58五种高危型，覆盖约90％宫颈癌病因，同时保留对6、11型的防护。九价疫苗对肛门癌、口咽癌等HPV相关癌症的预防效果更全面。

国内批准四价疫苗适用于20-45岁女性，九价疫苗最初仅限16-26岁女性接种，现部分区域扩展至9-45岁人群。男性接种适应症需参照当地规范。年龄限制差异与疫苗临床试验数据及免疫原性研究相关，扩展年龄后的九价疫苗逐渐成为更优选。

两种疫苗均需接种三剂，四价疫苗推荐0、2、6月程序，九价疫苗可采用0、1、6月或0、2、6月方案。免疫功能低下者可能需调整接种计划。疫苗间隔时间差异与抗体生成动力学有关，但全程接种后均可提供长期保护。

四价疫苗对宫颈癌前病变的保护效力约98％，九价疫苗因覆盖更多高危型别，总体保护率更高。临床数据显示九价疫苗对31/33/45/52/58型相关病变的预防效果达90％以上。两种疫苗对已感染亚型无治疗作用，因此推荐在性行为开始前接种。

两种疫苗不良反应相似，常见局部红肿或低热。九价疫苗因抗原种类更多，轻微不良反应发生率略高但无显著差异。优先推荐九价疫苗以获得更全面保护，若供应受限或超龄可选择四价疫苗。接种后仍需定期进行宫颈癌筛查。

无论选择哪种HPV疫苗，均需完成全程接种才能形成有效免疫保护。接种期间应避免妊娠，哺乳期女性需谨慎评估。疫苗防护并非终身有效，建议结合安全性行为及定期妇科检查。已接种四价疫苗者，可根据医生建议补种九价疫苗，但需间隔至少12个月。日常注意增强免疫力，减少吸烟等危险因素，可进一步降低HPV感染风险。