16岁月经两个月没来可能由青春期激素波动、精神压力、体重变化、多囊卵巢综合征、甲状腺功能异常等原因引起，可通过调整生活方式、心理疏导、药物治疗等方式改善。

1、激素波动：青春期女性激素水平尚未稳定，可能导致月经周期不规律。通常无需特殊治疗，随着身体发育逐渐恢复正常。

2、精神压力：学习压力、情绪波动等可能影响下丘脑-垂体-卵巢轴功能，导致月经推迟。建议通过放松训练、心理咨询等方式缓解压力。

3、体重变化：短期内体重显著增加或减少可能干扰激素分泌，影响月经周期。保持均衡饮食和适量运动有助于维持体重稳定。

4、多囊卵巢综合征：可能与遗传、胰岛素抵抗等因素有关，通常表现为月经稀发、多毛、痤疮等症状。治疗包括口服避孕药如炔雌醇环丙孕酮片、二甲双胍等药物。

5、甲状腺功能异常：甲状腺功能亢进或减退可能干扰月经周期。治疗需根据具体病情使用抗甲状腺药物如甲巯咪唑或甲状腺激素替代治疗如左甲状腺素钠片。

饮食方面，建议增加富含铁、维生素B12的食物，如瘦肉、鸡蛋、绿叶蔬菜，避免高糖、高脂肪饮食。运动可选择瑜伽、慢跑等有氧运动，每周3-5次，每次30分钟。保持规律作息，避免熬夜，有助于调节月经周期。如月经持续不规律，建议及时就医检查。