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生殖器疱疹潜伏期一般为2-12天，实际时间受到病毒载量、免疫状态、感染部位、首次感染或复发等多种因素的影响。
1、病毒载量病毒入侵数量较多时潜伏期可能缩短至2-3天，病毒量少时可达10天以上，需通过核酸检测确诊。
2、免疫状态免疫功能低下者潜伏期通常较短，艾滋病患者或长期使用免疫抑制剂者可能在感染后48小时内出现症状。
3、感染部位黏膜部位感染潜伏期较短，皮肤感染相对较长，男性阴茎冠状沟处感染平均潜伏期为5天。
4、感染类型原发性感染潜伏期较长约7-12天，复发性感染因体内存在抗体，潜伏期可缩短至3-5天。
潜伏期虽无临床症状但具有传染性，建议避免高危性行为，出现水疱或溃疡应及时到皮肤性病科就诊。
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