精子水样阴茎下面疼可能与尿道炎、前列腺炎、精囊炎、附睾炎、泌尿系统结石等因素有关，可通过抗感染治疗、物理治疗、手术干预等方式缓解。建议及时就医明确诊断。

尿道炎多由细菌感染引起，常见病原体包括大肠埃希菌、淋球菌等。患者可能出现尿道刺痛、排尿灼热感，伴随稀薄或浑浊分泌物。治疗需遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星片、头孢克肟分散片等抗生素，配合温水坐浴缓解不适。日常应保持会阴清洁，避免憋尿。

前列腺炎常因久坐、饮酒或细菌感染导致，表现为会阴部坠胀痛、射精后不适，精液可能变稀薄。可选用前列舒通胶囊、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等药物改善症状，辅以前列腺按摩治疗。患者需减少辛辣刺激食物摄入，规律排精有助于炎症消退。

精囊炎多与前列腺炎并发，典型症状为血精、射精疼痛，精液呈水样且量少。治疗需联合使用阿奇霉素肠溶片、癃清片等药物，严重者需进行精囊镜冲洗。发病期间应禁止性生活，避免骑自行车等压迫会阴部的行为。

附睾炎常由尿路感染蔓延所致，表现为阴囊坠痛、精索触痛，可能影响精液质量。急性期需卧床休息，使用注射用头孢曲松钠、布洛芬缓释胶囊控制感染和疼痛。慢性患者可配合阴囊托带减轻症状，避免睾丸局部受凉。

输尿管下段或膀胱结石可能刺激生殖区神经，引发放射性疼痛，同时影响精液排出状态。直径小于6毫米的结石可服用排石颗粒、双氯芬酸钠栓促进排出，较大结石需体外冲击波碎石。每日饮水2000毫升以上有助于预防结石复发。

出现精液性状改变合并疼痛时，建议记录症状持续时间、诱因及伴随表现，就诊时提供详细信息。避免自行服用抗生素或止痛药，以免掩盖病情。治疗期间穿宽松棉质内裤，禁止饮酒及剧烈运动。饮食宜清淡，适量补充南瓜子、牡蛎等含锌食物。若疼痛突然加重或发热，需立即急诊处理。