肾囊肿是否影响肾功能需根据囊肿类型和大小判断，单纯性肾囊肿通常不影响肾功能，而多囊肾可能导致肾功能受损。肾囊肿的影响因素主要有囊肿数量、囊肿增长速度、是否合并感染、是否压迫肾实质以及患者基础肾功能状态。

单纯性肾囊肿多为单发或少量存在，对肾小球滤过率和肾血流量无明显影响。体检发现的孤立性囊肿直径小于4厘米时，通常无须特殊处理，每年复查超声即可。当双侧肾脏囊肿总数超过3个时，需警惕常染色体显性多囊肾病的可能。

每年增长超过1厘米的囊肿可能对肾实质产生机械性压迫，导致局部肾单位缺血萎缩。快速增大的囊肿需通过CT增强扫描排除囊性肾癌，必要时行穿刺硬化治疗。多囊肾患者的囊肿增长速度与肾功能恶化速度呈正相关。

囊肿继发感染时可出现发热、腰痛症状，炎症反应可能波及周围正常肾组织。感染性囊肿需要足疗程使用左氧氟沙星、头孢曲松等能穿透囊壁的抗生素。反复感染会加速肾功能损伤进程。

直径超过5厘米的囊肿可能压迫肾盂或肾血管，引起肾性高血压或肾积水。严重压迫可能导致患侧肾功能进行性下降，此时可考虑腹腔镜下囊肿去顶减压术。术前需评估对侧肾脏代偿能力。

慢性肾病患者出现肾囊肿时更易发生肾功能恶化，尤其糖尿病肾病患者囊肿可能加速肾小球硬化。此类患者需严格控制血压血糖，定期监测血肌酐和估算肾小球滤过率。终末期多囊肾患者往往需要肾脏替代治疗。

肾囊肿患者应保持每日饮水量2000毫升以上，避免剧烈运动导致囊肿破裂，限制高嘌呤饮食预防尿酸升高。建议每6-12个月复查肾脏超声和肾功能，出现腰痛、血尿或尿量减少时及时就诊。合并高血压者需将血压控制在130/80毫米汞柱以下，可优先选择血管紧张素转换酶抑制剂类药物。