阴茎小颗粒伴随疼痛可能由毛囊炎、珍珠状阴茎丘疹、尖锐湿疣、生殖器疱疹、过敏反应等原因引起，可通过局部清洁、药物治疗、激光治疗等方式缓解。建议及时就医明确诊断。

阴茎皮肤毛囊感染可能导致红色丘疹伴疼痛，可能与局部卫生不良、摩擦刺激有关。表现为红肿颗粒且有压痛感。可遵医嘱使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等外用抗生素，配合温水坐浴促进炎症消退。日常需保持会阴干燥清洁。

冠状沟周围出现的珍珠样白色小颗粒，通常无痛感，但继发感染时可出现疼痛。可能与局部刺激或生理变异有关。一般无须治疗，若合并感染可外用红霉素软膏。避免过度清洗或使用刺激性洗剂。

人乳头瘤病毒感染引起的菜花样赘生物，摩擦破损后可能疼痛。表现为质地柔软的粉红色颗粒。需采用激光或冷冻去除疣体，并配合干扰素凝胶抑制病毒。具有传染性，应避免性接触直至痊愈。

单纯疱疹病毒导致簇集性水疱，破溃后形成疼痛性溃疡。常伴发热、腹股沟淋巴结肿大。可口服阿昔洛韦片、外用喷昔洛韦乳膏抗病毒。发作期需保持患处透气，避免抓挠引发继发感染。

接触安全套、洗涤剂等致敏物质后可能出现红色瘙痒性皮疹，严重时产生刺痛感。表现为密集小颗粒伴皮肤水肿。需停用可疑致敏物，口服氯雷他定片缓解症状。日常选择无香料洗护产品。

出现阴茎颗粒伴疼痛时应避免自行挤压或使用偏方，穿着宽松棉质内裤减少摩擦。观察是否伴随分泌物增多、发热等全身症状，记录皮疹变化情况供医生参考。性传播疾病需伴侣共同筛查治疗，治疗期间禁止饮酒及辛辣饮食。定期复查确保病情无进展。