肾囊肿的危害程度与囊肿大小、数量及是否引发并发症有关，多数单纯性肾囊肿无明显危害，但部分可能引起疼痛、感染或肾功能损害。

单纯性肾囊肿是肾脏常见的良性病变，体积较小时通常不会产生明显症状，多数在体检时偶然发现。这类囊肿生长缓慢，囊壁薄且光滑，囊液清亮，对周围肾实质压迫轻微，极少影响肾功能。患者可能终身无需特殊处理，仅需定期复查超声监测变化。但当囊肿直径超过5厘米时，可能因机械压迫导致腰部钝痛或胀痛，尤其在活动后加重。部分患者可能出现间歇性血尿，这与囊壁血管破裂有关。体积过大的囊肿还可能推挤邻近器官，引发消化不良或尿频等非特异性症状。

复杂性肾囊肿存在潜在危害风险，包括囊内出血、感染或癌变。当囊肿内液体突然增多或囊壁血管破裂时，可引发剧烈腰痛伴肉眼血尿，超声检查可见囊内回声增强。继发感染时会出现发热、寒战及尿路刺激症状，尿液检查显示白细胞升高。多囊肾等遗传性疾病造成的肾囊肿危害更为显著，随着囊肿数量增加，正常肾组织逐渐被取代，最终导致高血压和慢性肾功能衰竭。极少数情况下，囊壁细胞异常增生可能发展为囊性肾癌，增强CT检查可见囊壁结节或分隔增厚。

确诊肾囊肿后应每6-12个月复查肾脏超声，观察囊肿变化。日常避免剧烈运动和外伤，防止囊肿破裂。出现持续腰痛、血尿或发热时应及时就诊，复杂性囊肿可能需要穿刺引流或腹腔镜手术。保持低盐饮食和规律作息有助于维护肾功能，高血压患者需严格控压以减轻肾脏负担。