1饮食调整：发酵性腹泻应限制碳水化合物；腐败性腹泻应限制蛋白质的摄入增强肠粘膜的局部防御屏障功能防止细菌易位应增加纤维食物　　2抗菌药物：立即停止原抗生素应根据菌群分析以及抗菌药物敏感试验选用合适的抗生素以及抑制过度繁殖的细菌从而间接扶植肠道繁殖不足的细菌此外还可采用广谱抗菌药物将肠道细菌大部分消灭然后再灌入正常肠道菌群的菌液以使其恢复　　3活菌制剂：目前常用的活菌制剂有嗜酸乳杆菌保加利亚乳杆菌乳酸乳杆菌芽胞乳杆菌分叉乳杆菌粪链球菌大肠杆菌粪杆菌和枯草杆菌等其中以分叉乳杆菌制剂疗效最好枯草杆菌制剂疗效也较好其疗效机制可能是由于该菌是需氧的能吸收氧氧降低肠腔氧化还原电位支持厌氧菌（类杆菌乳杆菌）生长从而间接扶植了正常菌菌群还可以用正常人大便悬液做成复方活菌制剂用来治疗葡萄球菌引起的伪膜性肠炎收到较好的效果用乳酸链球菌制成的乳酶生临床广泛应用效果亦好适用肠道正常菌群中繁殖不足的耐药株做成制剂以利定值亦是调整肠道菌群失调的有效方法目前最新的生物制品丽珠肠乐（回春生胶囊）为双岐杆菌活菌制剂(bifidobiogne)据药一研究表明该制剂具有屏障作用控制内霉素血症作用营养作用抗肿瘤作用免疫增强作用抗衰老作用等　　4菌群促进剂：口服菌群促进剂亦可达到扶植正常菌群的目的如用乳醣扶植在肠杆菌用叶酸扶植肠球菌儿童常用分叉杆菌因子促进分叉乳杆菌生长应用半乳糖甙一果酸受细菌分解后形成乳酸或醋酸使pH值降低抑制其他细菌而支持乳杆菌生长　　5耐药性肠球菌制剂：日本目黑氏等采用增厚传代培养法获得了耐链霉素红霉素四环节氨苄青霉素的肠球菌一类链球菌BIO—4R株经动物和人体内试验表明本菌具有耐多种抗菌素性故能阻止其他菌群异常繁殖克服菌群失调改善大便性异常且比以往单用抗菌素治疗疗效迅捷并能防止粪链球菌BIO—4R株的耐药因子向大肠杆菌K—12株转移　　6中医中药：中医认为：“泄泻之本无不由于脾胃”急性泄泻病多偏实责在脾胃；慢性泄泻病多为虚每及脾肾前者当清热化湿后者应高补脾肾中药中的清热解毒药对体液免疫有影响如蒲公英白花蛇舌草等能促进抗体生成鱼腥草能提高备解素浓度而备解素C3Mg++组成的备解系统对痢疾杆菌沙门氏菌绿脓杆菌等革兰氏阴性杆菌有一定杀灭作用是机体产生抗体前的一种重要的非特异性的免疫防御功能在应用中医辩证论治治疗肠道菌群失调时均应考虑以上药物的作用于清热化湿补气健脾和胃渗湿温肾健脾等法中适当配伍应用则效果比较理想