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- 李侗曾副主任医师
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医院:
首都医科大学附属北京佑安医院
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综合感染科
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- 转帖:关于HIV-1 O/N的检测
- 作者:李侗曾|发布时间:2009-10-11|浏览量:2808次
HIV-1 O组最早于1990年发现于非洲的喀麦隆,直目前为止也主要限于中西非,例如喀麦隆、加蓬、乍得等国家。相对于全球广泛传播的HIV-1 M组病毒,O组的感染率非常低。例如,即便在发现HIV-1 O组感染者最多的喀麦隆,François Simon教授的研究结果表明,其感染率也仅仅为0.4%左右,而M组的感染率则达到了31.5%。HIV-1 O组病毒还偶尔零星发现于西方国家,如法国、美国、西班牙等,但总体极少见。美国于1996年和1997年发现了两例HIV-1 O组病毒感染,但这两位感染者都来自西非。迄今十多年过去了,最新的流行病学研究表明,美国仍没有发现新的HIV-1 O组感染病例。
HIV-1 N组病毒于1998年在喀麦隆被François Simon教授领导的研究小组发现。但是,N组病毒极其罕见,到目前为止,公开文献可以找到的仅仅为12例,而且全部来源于喀麦隆。要知道,有非常多的科学研究小组在中西非国家特别是喀麦隆和加蓬进行大规模的血液筛查和病毒学研究,因此这些统计数据是非常可信的。
病毒学研究
2005年,美国克利夫兰大学的研究小组发现HIV-1 M组病毒、HIV-2以及HIV-1 O组病毒感染人体T淋巴细胞的能力存在巨大的差异。他们将15株不同亚型的HIV-1 M组病毒、8株HIV-2病毒、6株HIV-1 O组病毒放在健康人捐献的血液中进行感染/竞争实验。实验结果表明,HIV-1 O组毒株在人体血液环境的繁殖能力比所有的HIV-1 M组毒株和HIV-2毒株低至少100倍,而大多数HIV-2毒株的繁殖能力也远远低于HIV-1 M组的毒株。这个研究结果有力地支持了流行病学的统计数据,正是HIV-1 O组病毒的传播能力和致病能力要比其它HIV病毒弱得多,才导致HIV-1 O组感染极为罕见。
从这个研究本身也可以推断出,HIV-1 N组病毒的传播感染能力肯定不会强于O组,否则,也不会N组病毒已经发现十年了,全球才发现12例感染病例。 北京佑安医院感染中心李侗曾
François Simon教授领导的研究小组关于快速试剂(即人们常说的金标法)对于不同HIV变种检测可靠性研究,这篇论文发表在2002年的《病毒学方法杂志》上。在评估试验中,François Simon教授使用了9个HIV-1 O组阳性血样及若干HIV-1 N组阳性血样,考虑到HIV-1 N组阳性血样非常稀少,因此他们只检测了凝胶法和快速法试剂,而快速法就包括了我国普遍采用的雅培Determine试剂。试验结果表明,雅培Determine试剂检测出了包括所有的HIV-1 O组和N组等79种不同基因型的阳性血样,灵敏度为100%。
从分子生物学的角度看,HIV-1 O组病毒应该比HIV-1 M组和N组更难检测一些,因为O组病毒不同毒株之间氨基酸序列差异较大,尤其是包膜蛋白(env),很难找到合适的共有序列(consensus),而M组和N组病毒的氨基酸序列就相对保守得多。从基因序列数据库(Genbank)可以查到几个N组毒株的氨基酸序列,通过软件分析,可以发现它们之间的基因差异要比M组更小,这一点与雅培实验室的研究小组得到的结论是一致的。因此,我们有理由相信,HIV-1 N组是可以检测的。
科学地讲,任何试剂都不能说可以检测所有的HIV变种,因为现实中无法做到这样的测试。但是,迄今为止并没有发现一种HIV变种它无法被所有的甚至大多数试剂检测。这说明尽管HIV变异和重组很频繁,但并没有违反目前人们认识的规律。另一方面,从概率的角度看,不同试剂检测相当于独立事件,假设每种试剂的漏检率低于千分之一,那三种试剂检测同时漏检的概率就只有十亿分之一。想想看,可能有那么极端的情况出现么?当然,这种分析的前提假设是否合理需要讨论。
现在国外的第四代HIV试剂都普遍加入了HIV-1 O组的合成肽或者重组抗原,例如生物梅里埃(bioMerieux)、雅培(Abbott Laboratories)、伯乐(Bio-Rad Laboratories)等,其实国外很多第三代试剂也就包含了O组抗原。国内试剂在公开文献中很少看到关于其性能评估的研究,因此不是很了解,也无法评价。
从试剂的性能来看,这些著名公司的产品基本上都能够检测出所有的HIV病毒抗体,无论是HIV-1 M组、O组、N组还是HIV-2,这方面的研究论文和评估报告非常多,感兴趣的话可以参阅例如《临床微生物学杂志》(Journal of clinical microbiology)、《病毒学方法杂志》(Journal of virological methods)、《医学病毒学杂志》(Journal of medical virology)等相关论文。
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