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- 基因表达的系列分析技术(SAGE)
- 作者:常树建|发布时间:2009-08-26|浏览量:1932次
基因表达的系列分析(SAGE)是一种鉴定特定组织在特定阶段所转录基因集合(转录组)的技术。最终获得的序列可用于它们所代表基因的鉴定:对每一个基因来讲,SAGE分析所获序列是非常短的(仅12个核苷酸的顺序),但通过与数据库的对比,这个短序列足以代表它所起源的基因。 SAGE亦可用来估计每个经鉴定的基因的转录频率,因为SAGE结果中某短序列的频率是与其对应序列在所获序列的总的集合中的频率成比例的。无锡市第四人民医院肿瘤科常树建
SAGE方法已用于含有大约15000个转录本的酵母的研究,75%的基因表达得以探测,表达水平从0.3-400不等。许多单一基因(orphan gene)或小序列基因也被探测到了,这表明这些基因的大部分得到了转录。
SAGE也用于人类基因转录的研究,目的是鉴定各种肿瘤组织中转录的基因,比如结肠癌中总共约9700个基因得以鉴定,其表达水平在每个细胞中存在1-5300个拷贝不等。超过40%的基因是新发现基因。这些基因的表达水平在肿瘤组织中可能要比在正常组织中的表达水平高。肿瘤组织与正常组织对比,在548个表达水平不同的基因中,有337个基因是已知的。在正常结肠组织中表达水平较高的基因包括涉及组织结构和细胞生理学方面的基因,比如细胞角蛋白,碳酸酐酶和guanyline。在结肠肿瘤组织中高水平表达的许多基因都与细胞的生长有关,比如核糖体蛋白,翻译延长因子,糖酵解酶,胰岛素样生长因子(IGFⅡ),细丝蛋白(和肌动蛋白相关联)等。
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